Maukallaqta esta dividido en cinco sectores: Plaza pampa, Pucara, Yuractorriyoc, Q´epa y Aq´otambo, el asentamiento presenta edificaciones circulares y semicirculares de gran diámetro que alternan con otras estructuras como muros y vanos de acceso claramente influenciados a las culturas de Collao, Inca y Colonial, presenta un camino inca Qhapaq ñan que pasa por el medio del complejo arqueológico, y exhibe una capilla colonial quizás la primera en el altiplanicie de la nación K´ana.
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